Acide aminé
En bref : Les acides aminés sont les éléments constitutifs des peptides et des protéines. Vingt d'entre eux sont codés par le code génétique ; la synthèse utilise aussi des formes modifiées.
Chaque acide aminé porte un groupe amine, un groupe carboxyle et une chaîne latérale. C'est cette chaîne latérale qui détermine si le maillon est plutôt hydrophile ou hydrophobe, et s'il porte une charge.
Les acides aminés sont reliés par la liaison peptidique, qui unit le groupe carboxyle de l'un au groupe amine du suivant. L'écriture d'une séquence suit ce sens : de l'extrémité amine libre (N-terminale) à l'extrémité carboxyle libre (C-terminale).
Dans les noms de produits, les acides aminés apparaissent sous forme d'abréviations. KPV, par exemple, désigne la lysine, la proline et la valine : trois maillons, trois lettres.
Au laboratoire, les chaînes latérales comptent surtout pour la solubilité et la plage de pH favorable. Beaucoup d'arginine, de lysine et d'histidine rendent une molécule basique ; beaucoup d'acide aspartique et d'acide glutamique la rendent acide. Les résidus basiques fixent aussi le contre-ion.
Deux acides aminés méritent une attention particulière, car ils sont sensibles à l'oxydation : la cystéine et la méthionine. Lorsqu'une séquence en contient, le diméthylsulfoxyde (DMSO) est pratiquement exclu comme solvant.
En synthèse en phase solide, un seul acide aminé est ajouté à chaque cycle. Le nombre de maillons correspond donc au nombre d'étapes de travail, ce qui explique en partie pourquoi les séquences longues coûtent plus cher que les courtes.
Termes associés
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