Contre-ion
En bref : Un contre-ion est une particule chargée qui reste associée au peptide après la synthèse et en compense la charge. Pour les peptides de synthèse, il s'agit le plus souvent du trifluoroacétate (TFA).
Le contre-ion provient de la purification et il a une masse. La masse présente dans le flacon est donc supérieure à celle du peptide pur ; la différence apparaît dans la teneur en peptide.
Certains certificats indiquent la part de contre-ion séparément, d'autres seulement la teneur en peptide. Les deux valeurs décrivent la même réalité sous deux angles.
La quantité de contre-ion dépend de la séquence : il se fixe sur les chaînes latérales basiques, c'est-à-dire l'arginine, la lysine et l'histidine. Une séquence riche en résidus basiques en porte nettement plus qu'une séquence qui en contient peu.
Il s'ensuit que cette part n'est pas un critère de qualité. Une teneur élevée en trifluoroacétate n'est pas un défaut, mais une propriété de la molécule et de sa purification. Elle ne devient pertinente que si le TFA risque d'interférer avec l'expérience prévue ; on peut alors se tourner vers des préparations sous forme d'acétate.
En pratique, la quantité nominale inscrite sur l'étiquette est une limite supérieure de la quantité de peptide contenue. L'origine du TFA est expliquée à l'entrée synthèse peptidique en phase solide.
Termes associés
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