Solubilité
En bref : La solubilité décrit la facilité avec laquelle une substance se répartit dans un solvant. Pour les peptides, elle dépend surtout des chaînes latérales des acides aminés et du pH.
Les peptides riches en chaînes latérales chargées se dissolvent généralement bien dans l'eau. Ceux qui comptent beaucoup de chaînes latérales hydrophobes se dissolvent moins bien et nécessitent un milieu acide ou basique.
Si un résidu reste non dissous après avoir fait tourner patiemment le flacon, c'est le signe d'un peptide peu soluble dans l'eau. Agiter vigoureusement n'aide pas et sollicite au contraire davantage la substance.
La clé est la charge nette. Un peptide est le moins soluble là où ses charges positives et négatives s'équilibrent exactement : au point isoélectrique. En éloignant le pH de ce point, les molécules se repoussent mutuellement et passent plus facilement en solution.
Il en découle une règle simple : préparer les séquences basiques en milieu acide, les séquences acides en milieu légèrement basique. Dans le premier cas, l'acide acétique dilué est la voie habituelle, proposé dans la boutique parmi les réactifs de laboratoire ; les solvants organiques sont le dernier recours, et le plus mauvais choix lorsque la séquence contient de la cystéine ou de la méthionine.
Si une solution reste trouble ou présente des filaments, c'est une raison de ne pas poursuivre : des particules non dissoutes en suspension signifient que chaque prélèvement contient une quantité différente. Les gestes de base sont décrits à l'entrée reconstitution.
Termes associés
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